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Text File  |  1995-07-26  |  2.4 KB  |  50 lines
  1. *********************************************************************
  2. * Phosphoglucomutase and phosphomannomutase phosphoserine signature *
  3. *********************************************************************
  4.  
  5.  - Phosphoglucomutase (EC 5.4.2.2) (PGM). PGM  is  an  enzyme  responsible for
  6.    the conversion  of  D-glucose 1-phosphate into  D-glucose 6-phosphate.  PGM
  7.    participates in both the breakdown and synthesis of glucose [1].
  8.  - Phosphomannomutase (EC 5.4.2.8) (PMM).  PMM  is  an enzyme  responsible for
  9.    the conversion of D-mannose 1-phosphate into D-mannose 6-phosphate.  PMM is
  10.    required for  different biosynthetic pathways in bacteria.  For example, in
  11.    enterobacteria  such  as Escherichia coli  there  are  two  different genes
  12.    coding for this  enzyme:  rfbK  which is involved in the synthesis of the O
  13.    antigen of lipopolysaccharide and cpsG  which is required for the synthesis
  14.    of the M antigen capsular polysaccharide [2]. In Pseudomonas aeruginosa PMM
  15.    (gene algC) is  involved  in the biosynthesis of the alginate layer [3] and
  16.    in Xanthomonas campestris (gene xanA) it is involved in the biosynthesis of
  17.    xanthan [4].
  18.  
  19. The  catalytic  mechanism  of  both  PGM  and  PMM involves the formation of a
  20. phosphoserine intermediate [1].  The sequence around the serine residue is
  21. well conserved and can be used as a signature pattern.
  22.  
  23. In addition to PGM and PMM there  are  at least three uncharacterized proteins
  24. that belong to this family [5]:
  25.  
  26.  - Urease operon protein ureC from Helicobacter pylori.
  27.  - Escherichia coli hypothetical protein yhbF.
  28.  - A Methanococcus vannielii hypothetical protein  in the 3'region of the gene
  29.    for ribosomal protein S10.
  30.  
  31. -Consensus pattern: [GA]-[LIVM]-x-[LIVM]-[ST]-[PGA]-S-H-x-P-x(4)-[GN]
  32.                     [S is the phosphoserine residue]
  33. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  34. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  35.  
  36. -Note: PMM from fungi do not belong to this family.
  37.  
  38. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  39.  
  40. [ 1] Dai J.B., Liu Y., Ray W.J. Jr., Konno M.
  41.      J. Biol. Chem. 267:6322-6337(1992).
  42. [ 2] Stevenson G., Lee S.J., Romana L.K., Reeves P.R.
  43.      Mol. Gen. Genet. 227:173-180(1991).
  44. [ 3] Zielinski N.A., Chakrabarty A.M., Berry A.
  45.      J. Biol. Chem. 266:9754-9763(1991).
  46. [ 4] Koeplin R., Arnold W., Hoette B., Simon R., Wang G., Puehler A.
  47.      J. Bacteriol. 174:191-199(1992).
  48. [ 5] Bairoch A.
  49.      Unpublished observations (1993).
  50.